119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4552 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4552  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  347  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  45.28 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  38.01 
 
 		 182 aa  127  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  40.4 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  36.21 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  38.96 
 
 		 183 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  39.74 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  39.47 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  38.96 
 
 		 183 aa  115  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  37.21 
 
 		 183 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  38.31 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  38.31 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  38.31 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  38.31 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  38.31 
 
 		 183 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  37.01 
 
 		 183 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  37.66 
 
 		 183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  36.05 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  35.33 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  36.54 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  36.54 
 
 		 177 aa  108  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  35.9 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  37.18 
 
 		 177 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  40.12 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  34.62 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  34.62 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  35.48 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2233  hypothetical protein  35.09 
 
 		 175 aa  104  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.305733  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  33.97 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  33.97 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  33.55 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  31.85 
 
 		 185 aa  99  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4389  hypothetical protein  36.08 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  35.26 
 
 		 177 aa  95.9  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  34.19 
 
 		 200 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  33.75 
 
 		 174 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  94  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  30.91 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  34.44 
 
 		 177 aa  91.3  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3741  hypothetical protein  33.12 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  32.24 
 
 		 179 aa  90.1  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  32.47 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  32.47 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  32.47 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  32.47 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  32.47 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  32.47 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  32.47 
 
 		 199 aa  86.7  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  31.71 
 
 		 197 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  85.1  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  33.92 
 
 		 179 aa  85.1  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  29.94 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  30.3 
 
 		 178 aa  84.7  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2414  hypothetical protein  32.89 
 
 		 182 aa  84  9e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.31383  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  33.77 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  32.28 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  27.61 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0571  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  28.99 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  30.52 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  30.52 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  29.87 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  32.28 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0846  hypothetical protein  29.24 
 
 		 179 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.512108  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  29.87 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  29.87 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  29.87 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  29.87 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  32.93 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  34.59 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0021  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  29.61 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  32.5 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  30.95 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4155  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4464  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000293332  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  29.75 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0596  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1237  protein of unknown function DUF615  29.94 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0415  hypothetical protein  30.07 
 
 		 180 aa  72  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  30.38 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1335  hypothetical protein  27.43 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.154229 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  29.75 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>