119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0415 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0415  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  362  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4389  hypothetical protein  74.3 
 
 		 179 aa  283  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0571  hypothetical protein  72.07 
 
 		 179 aa  266  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3741  hypothetical protein  64.97 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0593  hypothetical protein  57.63 
 
 		 178 aa  200  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3806  hypothetical protein  57.63 
 
 		 178 aa  200  9e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0537  hypothetical protein  57.63 
 
 		 178 aa  200  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0511  hypothetical protein  57.63 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0532  hypothetical protein  57.63 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.993858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3068  hypothetical protein  55.87 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4079  hypothetical protein  56.82 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3456  hypothetical protein  56.25 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0494  hypothetical protein  56.25 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3632  hypothetical protein  56.25 
 
 		 177 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3722  hypothetical protein  55.11 
 
 		 177 aa  191  7e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000177503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0481  hypothetical protein  51.38 
 
 		 182 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.275337 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0192  hypothetical protein  38.98 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0148149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1131  hypothetical protein  39.49 
 
 		 168 aa  99  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0187042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00272  hypothetical protein  33.54 
 
 		 185 aa  97.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1326  hypothetical protein  37.42 
 
 		 177 aa  96.7  2e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2116  hypothetical protein  39.47 
 
 		 193 aa  96.7  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1170  hypothetical protein  38.89 
 
 		 182 aa  96.3  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0143293 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0425  hypothetical protein  37.65 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0489  hypothetical protein  37.65 
 
 		 182 aa  94.4  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03672  hypothetical protein  35.33 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4387  hypothetical protein  36.84 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3664  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002396  putative alpha helix protein  35.5 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12730  hypothetical protein  36.54 
 
 		 172 aa  91.3  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2147  hypothetical protein  35.58 
 
 		 176 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257138  normal  0.566997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3822  hypothetical protein  36.77 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5087  hypothetical protein  34.55 
 
 		 174 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0266  hypothetical protein  35.8 
 
 		 183 aa  88.2  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0906  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0241  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  87.8  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0390  hypothetical protein  32.76 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0274  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.649245  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2533  hypothetical protein  32.76 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.914076  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4782  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4837  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4687  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.67161  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4719  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.68666  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4817  hypothetical protein  34.83 
 
 		 183 aa  87.8  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1672  hypothetical protein  32.18 
 
 		 205 aa  87.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58060  hypothetical protein  34.55 
 
 		 200 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0123622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2955  hypothetical protein  32.76 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2906  hypothetical protein  32.76 
 
 		 199 aa  87  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0421  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0491  hypothetical protein  37.34 
 
 		 179 aa  86.7  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0944  hypothetical protein  35.93 
 
 		 208 aa  85.9  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.372489  normal  0.0275121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2846  hypothetical protein  32.93 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.913933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0780  hypothetical protein  33.53 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.912391  normal  0.0586542 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1560  hypothetical protein  36.47 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.594632  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2223  hypothetical protein  34.08 
 
 		 203 aa  84.7  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04102  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3760  protein of unknown function DUF615  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5753  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3184  hypothetical protein  32.93 
 
 		 178 aa  84.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.836007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04066  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4487  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4804  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3777  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4712  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.7  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4850  hypothetical protein  34.27 
 
 		 183 aa  84.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0970  protein of unknown function DUF615  35.97 
 
 		 220 aa  84.3  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2571  hypothetical protein  34.21 
 
 		 202 aa  84.3  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3553  protein of unknown function DUF615  35.54 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0886  hypothetical protein  36.75 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.666466 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2888  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0815  hypothetical protein  36.75 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01892  hypothetical protein  37.8 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1052  hypothetical protein  35.25 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.457164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0956  hypothetical protein  33.9 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0960  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1018  hypothetical protein  33.54 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2966  hypothetical protein  36.43 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.119869  normal  0.461919 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0601  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1080  hypothetical protein  34.13 
 
 		 203 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1039  hypothetical protein  34.13 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4194  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1911  hypothetical protein  31.17 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.320466  unclonable  0.00000673903 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00400035  normal  0.0106764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0864  hypothetical protein  32.73 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4552  hypothetical protein  30.07 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0864  hypothetical protein  32.48 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2322  hypothetical protein  36.23 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0300242  normal  0.462605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0941  hypothetical protein  32.03 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.607933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2265  protein of unknown function DUF615  36.3 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0910  hypothetical protein  31.97 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.968219  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0583  hypothetical protein  33.94 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0402965  normal  0.143572 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0981  hypothetical protein  32.03 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.694698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4274  hypothetical protein  30.72 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.171869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3288  hypothetical protein  33.83 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.632855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0948  hypothetical protein  32.03 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2721  hypothetical protein  31.82 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0949713  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0352  hypothetical protein  34.16 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2422  hypothetical protein  33.94 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.946472  normal  0.185429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2897  hypothetical protein  34.62 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0022  hypothetical protein  29.75 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2013  hypothetical protein  32.39 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>