87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2161 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2161  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.114722 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1562  ferrichrome-binding protein  29.1 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 		 195 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0401409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3136  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.263014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2425  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280339  normal  0.117727 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  37.96 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4212  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684099  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  37.25 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0587  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 		 199 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2469  GCN5-related N-acetyltransferase  36.14 
 
 		 182 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000337627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0425  hypothetical protein  35 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.964895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  36.9 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0112  hypothetical protein  41.67 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1834  acetyltransferase  36.9 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4284  acetyltransferase  37.8 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.461205  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000873  putative acetyltransferase  36.78 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4725  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 213 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0497558  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4196  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 182 aa  48.5  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3281  GCN5-related N-acetyltransferase  30.3 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0226933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2643  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 		 177 aa  47.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1239  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.686907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3008  GCN5-related N-acetyltransferase  43.33 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3872  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0161131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1465  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0333555 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2857  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000286038  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4412  GCN5-related N-acetyltransferase  31.97 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0155  GCN5-related N-acetyltransferase  36.89 
 
 		 199 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.852319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1464  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0310541 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6108  GCN5-related N-acetyltransferase  39.02 
 
 		 176 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.410828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0441  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6181  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2956  hypothetical protein  36.99 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1366  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2043  GCN5-related N-acetyltransferase  34.41 
 
 		 198 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.221782 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0408  acetyltransferase-related protein  31.37 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0990149  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2455  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000222061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3412  GCN5-related N-acetyltransferase  43.04 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.885051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1526  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  38.67 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.121319  unclonable  0.0000303298 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2786  GCN5-related N-acetyltransferase  35.16 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0734111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3088  hypothetical protein  25.76 
 
 		 179 aa  44.3  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.324318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4875  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 		 199 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.303527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6831  GCN5-related N-acetyltransferase  37.18 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0248  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3070  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000252712  hitchhiker  0.000932566 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1005  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2123  GCN5-related N-acetyltransferase  27.88 
 
 		 179 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0562469  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1747  GCN5-related N-acetyltransferase  25.9 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00283378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2709  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000725277 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0106  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.191154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0516  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1671  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135635  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1931  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1463  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0311818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0849  acetyltransferase  23.64 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3821  putative acetyltransferase  31.86 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1634  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3893  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 		 190 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.430591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21710  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  37.93 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.649805 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5042  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668366  normal  0.445888 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3513  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2617  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000214426 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3250  GCN5-related N-acetyltransferase  26.15 
 
 		 173 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.101542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1003  GCN5-related N-acetyltransferase  44.07 
 
 		 184 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2625  GCN5-related N-acetyltransferase  44.64 
 
 		 179 aa  42  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  24.32 
 
 		 197 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0454566  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0978  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2280  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 176 aa  42  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2144  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 209 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72544 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  35.56 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.839028  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00987  N-acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00765)  26.28 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.721278 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3916  GCN5-related N-acetyltransferase  41.79 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.229048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  31.82 
 
 		 181 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0176  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.398675  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2496  GCN5-related N-acetyltransferase  32.91 
 
 		 193 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3459  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.388248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1649  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2570  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 		 192 aa  41.2  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.345636  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2564  GCN5-related N-acetyltransferase  39.51 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.451663  normal  0.927347 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3801  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4920  GCN5-related N-acetyltransferase  33.73 
 
 		 199 aa  40.8  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0104607  normal  0.573545 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3105  GCN5-related N-acetyltransferase  35.05 
 
 		 177 aa  40.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2125  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 191 aa  40.4  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>