37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0800 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  56.25 
 
 		 210 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  47.06 
 
 		 193 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  44.51 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  39.02 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  44.51 
 
 		 170 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  47.13 
 
 		 182 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  39.67 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  38.74 
 
 		 187 aa  104  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  34.87 
 
 		 256 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  40.61 
 
 		 199 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  32.84 
 
 		 200 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  35.22 
 
 		 184 aa  87.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  32.93 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  52.63 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  40.96 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  61.22 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  42.35 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  32.05 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  52.83 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  57.14 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  29.91 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0852  Terminase small subunit  25.97 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  46.48 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  46.48 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  29.91 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  45.68 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  26.67 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  40 
 
 		 338 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  29.28 
 
 		 164 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  29.28 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1897  phage terminase small subunit  30.72 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2568  hypothetical protein  31.4 
 
 		 284 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  29.17 
 
 		 143 aa  48.9  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3746  putative phage terminase, small subunit  26.52 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0046  putative phage terminase, small subunit  26.52 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0613  putative phage terminase, small subunit  26.92 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>