27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1698 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  100 
 
 		 336 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  37.74 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  39.51 
 
 		 338 aa  135  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  39.02 
 
 		 192 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  53.85 
 
 		 182 aa  97.4  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  33.96 
 
 		 210 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  54.22 
 
 		 187 aa  94  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  56.96 
 
 		 164 aa  90.9  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  53.85 
 
 		 170 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  53.85 
 
 		 170 aa  90.1  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  30.15 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  31.84 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  45.57 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  44.19 
 
 		 199 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  52.38 
 
 		 233 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  41.67 
 
 		 147 aa  70.5  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  41.76 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  41.76 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  40 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  41.38 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  29.06 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  40.79 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  40.79 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  37.35 
 
 		 183 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  37.18 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  34.44 
 
 		 143 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2162  hypothetical protein  29.85 
 
 		 280 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00865051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>