17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2228 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  709    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  41.46 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  39.51 
 
 		 336 aa  123  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  33.49 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4010  hypothetical protein  54.55 
 
 		 245 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  40.66 
 
 		 164 aa  64.3  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  25.54 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  40 
 
 		 192 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  24.76 
 
 		 256 aa  50.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  37.35 
 
 		 170 aa  49.7  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  37.35 
 
 		 170 aa  49.7  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3538  hypothetical protein  34.65 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1153  hypothetical protein  46.67 
 
 		 209 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039121  hitchhiker  0.00000000000317402 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  36.36 
 
 		 184 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  36.78 
 
 		 199 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2267  phage protein  38.57 
 
 		 218 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000190107 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  38.03 
 
 		 193 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>