22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1425 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  100 
 
 
146 aa  290  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  66.18 
 
 
155 aa  175  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  50.72 
 
 
143 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  47.52 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  52.89 
 
 
170 aa  114  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  43.75 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  50.82 
 
 
173 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  50.82 
 
 
173 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  33.95 
 
 
164 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  33.95 
 
 
189 aa  77.4  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  32.67 
 
 
170 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  32 
 
 
170 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  32.7 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  52.83 
 
 
192 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  32.76 
 
 
182 aa  57  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  39.47 
 
 
233 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  31.73 
 
 
336 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  30.92 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  28.57 
 
 
183 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  33.33 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  33.33 
 
 
129 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  29.25 
 
 
210 aa  40.4  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>