29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1220 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  100 
 
 		 183 aa  378  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  53.97 
 
 		 187 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  55.35 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  46.62 
 
 		 199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  36.84 
 
 		 182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  36.13 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  35.44 
 
 		 170 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  32.93 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  30.48 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  32.17 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3746  putative phage terminase, small subunit  30.85 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0613  putative phage terminase, small subunit  31.38 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0046  putative phage terminase, small subunit  30.32 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  32.05 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0552  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0175758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  25.84 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  25.84 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  37.66 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  37.35 
 
 		 336 aa  53.9  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  38.16 
 
 		 237 aa  52  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  44.23 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  57.89 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  57.89 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  31.65 
 
 		 129 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  25.29 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  31.65 
 
 		 133 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  29.93 
 
 		 324 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  40.79 
 
 		 170 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  38.81 
 
 		 147 aa  40.8  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>