25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2256 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  100 
 
 		 147 aa  298  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  54.17 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  54.17 
 
 		 173 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  51.3 
 
 		 170 aa  120  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  43.71 
 
 		 155 aa  117  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  43.06 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  37.61 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  35.34 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  41.67 
 
 		 336 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  51.79 
 
 		 233 aa  67  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  59.18 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  43.48 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  43.48 
 
 		 170 aa  63.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  38.32 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  38.32 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  57.14 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  64.29 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  36.49 
 
 		 177 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  33.78 
 
 		 199 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  43.9  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  59.38 
 
 		 164 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  59.38 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  32.43 
 
 		 193 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  38.81 
 
 		 183 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 237 aa  40  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>