25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1745 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  100 
 
 		 177 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  63.46 
 
 		 187 aa  204  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  60 
 
 		 199 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  55.35 
 
 		 183 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  44.3 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  32.28 
 
 		 170 aa  86.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  32.28 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  38.37 
 
 		 210 aa  85.5  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  37.04 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  31.36 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  34.67 
 
 		 164 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  38.37 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  37.97 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  40.51 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  38.27 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  40.48 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  36.49 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  46.67 
 
 		 233 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  36.99 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  36.23 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  36.23 
 
 		 173 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  29.07 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  29.07 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  36.25 
 
 		 338 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2240  hypothetical protein  33.85 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.412512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>