26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0603 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  100 
 
 		 173 aa  341  2.9999999999999997e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  50.62 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  54.17 
 
 		 147 aa  127  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  55.81 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  49.18 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  42.37 
 
 		 143 aa  101  6e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  45 
 
 		 149 aa  90.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  41.76 
 
 		 336 aa  68.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  57.14 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  57.14 
 
 		 170 aa  68.2  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  57.69 
 
 		 233 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  55.17 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  47.89 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  46.48 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  38.14 
 
 		 189 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  38.14 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  43.64 
 
 		 199 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  32.46 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  48.98 
 
 		 193 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  57.89 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  32.94 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  36.23 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  32.38 
 
 		 237 aa  42.4  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1043  hypothetical protein  37.93 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0831119  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  37.29 
 
 		 232 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>