26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2473 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  100 
 
 		 149 aa  299  7.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  54.36 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  49.69 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  46.05 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  45 
 
 		 173 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  45 
 
 		 173 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  42.5 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  35.34 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  36.47 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  36.47 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3746  putative phage terminase, small subunit  34.78 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0046  putative phage terminase, small subunit  34.78 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0613  putative phage terminase, small subunit  33.7 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  31.52 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  37.97 
 
 		 210 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  28.29 
 
 		 170 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  27.63 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  35.06 
 
 		 164 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  43.64 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  43.64 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  34.65 
 
 		 182 aa  43.9  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0852  Terminase small subunit  28.46 
 
 		 291 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1158  phage terminase, small subunit, putative  29.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  35.9 
 
 		 338 aa  41.2  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  30.38 
 
 		 336 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  27.62 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>