30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0565 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  100 
 
 
233 aa  481  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1385  hypothetical protein  52.53 
 
 
239 aa  98.6  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1329  hypothetical protein  48.48 
 
 
236 aa  91.3  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  31.89 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  45.78 
 
 
182 aa  73.9  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  50 
 
 
336 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  49.35 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  49.35 
 
 
170 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  28.79 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  57.69 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  57.69 
 
 
173 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  40.45 
 
 
170 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  51.79 
 
 
147 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  61.22 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  52.38 
 
 
193 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  38.37 
 
 
164 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  39.47 
 
 
146 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  41.67 
 
 
232 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  46.77 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  44.07 
 
 
155 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  48.33 
 
 
324 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  33.72 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  46.67 
 
 
177 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  31.43 
 
 
143 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  29.12 
 
 
164 aa  45.4  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  29.12 
 
 
189 aa  45.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2240  hypothetical protein  40.35 
 
 
166 aa  44.7  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.412512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  45.65 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0613  putative phage terminase, small subunit  28.35 
 
 
200 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>