31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2472 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  100 
 
 		 164 aa  333  5.999999999999999e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  65.85 
 
 		 184 aa  226  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  45.98 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  39.04 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  42.28 
 
 		 170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  42.28 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  39.67 
 
 		 192 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  38.89 
 
 		 193 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  56.96 
 
 		 336 aa  90.9  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  52.5 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  35.52 
 
 		 256 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  40.65 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  37.09 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  32.93 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  50 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  40.66 
 
 		 338 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  40.23 
 
 		 324 aa  58.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  38.37 
 
 		 233 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  30.38 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  27.08 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  27.08 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  32.46 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  32.46 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  35.06 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  31.08 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  59.38 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  29.11 
 
 		 133 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1897  phage terminase small subunit  28.57 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  29.11 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  43.14 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>