37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4100 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  56.25 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  55.06 
 
 		 193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  45.98 
 
 		 164 aa  129  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  44.07 
 
 		 187 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  38.98 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  40.96 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  39.16 
 
 		 170 aa  102  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  37.22 
 
 		 184 aa  99.8  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  36.07 
 
 		 256 aa  97.4  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  33.96 
 
 		 336 aa  92.8  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  39.29 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  33.49 
 
 		 338 aa  84.7  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  53.95 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  36.81 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  31.89 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0046  putative phage terminase, small subunit  30.86 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0613  putative phage terminase, small subunit  31.43 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3746  putative phage terminase, small subunit  30.29 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  30.48 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  28.73 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1897  phage terminase small subunit  30.11 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  35.59 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0852  Terminase small subunit  26.06 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  36.73 
 
 		 324 aa  51.6  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  37.97 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0054  hypothetical protein  30.11 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0442309  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0552  hypothetical protein  32 
 
 		 112 aa  50.1  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0175758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  34.21 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  28.18 
 
 		 133 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  27.75 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  27.75 
 
 		 164 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  27.78 
 
 		 129 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  35.87 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  59.38 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  58.82 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2568  hypothetical protein  34.58 
 
 		 284 aa  41.2  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>