29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2110 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  100 
 
 		 170 aa  338  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  50.62 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  50.62 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  51.3 
 
 		 147 aa  120  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1425  Terminase small subunit  51.24 
 
 		 146 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  51.24 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2948  terminase small subunit  42.74 
 
 		 143 aa  89.7  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2473  terminase small subunit  42.5 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  41.38 
 
 		 336 aa  67.8  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  40.45 
 
 		 233 aa  67.4  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  47.3 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  46.05 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  46.05 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  42.35 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  37.27 
 
 		 164 aa  60.8  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  38.54 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  44.44 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  41.27 
 
 		 237 aa  48.1  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  35.87 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  36.99 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  30.12 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  26.52 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  29.76 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  40.79 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  29.76 
 
 		 129 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  43.14 
 
 		 164 aa  42.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  30.95 
 
 		 232 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  36.54 
 
 		 184 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0852  Terminase small subunit  29.21 
 
 		 291 aa  41.2  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000936186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>