27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2403 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  58.62 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  55.36 
 
 		 177 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  46.62 
 
 		 183 aa  146  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  44.59 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  36.59 
 
 		 170 aa  95.5  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  36.59 
 
 		 170 aa  95.1  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  40.61 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  36.05 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  36.81 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  44.19 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  35.76 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  40.65 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  49.37 
 
 		 193 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  41.77 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  41.46 
 
 		 324 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  46.77 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  43.64 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  43.64 
 
 		 173 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  30 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0948  phage terminase, small subunit  35.05 
 
 		 155 aa  46.6  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  36.78 
 
 		 338 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  26.52 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2256  Phage terminase, small subunit  33.78 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0094  hypothetical protein  32.89 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  24.5 
 
 		 164 aa  42  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  24.5 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>