20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1080 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 211 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  34.87 
 
 		 192 aa  102  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  36.07 
 
 		 210 aa  95.9  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  30.91 
 
 		 170 aa  90.1  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2568  hypothetical protein  37.58 
 
 		 284 aa  89.4  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  30.3 
 
 		 170 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  30.15 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  33.52 
 
 		 193 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  35.52 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  35.76 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  47.95 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  30 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  29.1 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  41.67 
 
 		 177 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  34.21 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  27.23 
 
 		 182 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  24.76 
 
 		 338 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  26.02 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  45.65 
 
 		 233 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>