24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2549 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2549  terminase small subunit  100 
 
 		 184 aa  366  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.754839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  65.85 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  37.22 
 
 		 210 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  34.93 
 
 		 170 aa  92.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  34.93 
 
 		 170 aa  91.7  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1829  terminase small subunit  35.06 
 
 		 187 aa  90.9  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926701 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  35.22 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  46.34 
 
 		 193 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1698  terminase small subunit  45.57 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.401106  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2715  terminase small subunit  32.05 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  47.95 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2403  terminase small subunit  41.77 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1745  terminase small subunit  39.19 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000782876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  34 
 
 		 232 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1099  hypothetical protein  32.18 
 
 		 324 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0156489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0565  terminase small subunit  27.08 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  29.45 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2228  hypothetical protein  36.36 
 
 		 338 aa  48.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0103157  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1220  terminase small subunit  25.29 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0665  Phage terminase, small subunit  32.94 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000564827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0603  Phage terminase, small subunit  32.94 
 
 		 173 aa  45.1  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00383652  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2401  phage terminase, small subunit  28.75 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0319219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2364  phage terminase, small subunit  28.75 
 
 		 129 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2110  Phage terminase, small subunit  37.25 
 
 		 170 aa  41.2  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.242575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>