15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1897 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1897  phage terminase small subunit  100 
 
 		 166 aa  333  5.999999999999999e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.94063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4100  terminase small subunit  31.82 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000879994 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3431  hypothetical protein  47.37 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0054  hypothetical protein  37.06 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0442309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0800  terminase small subunit  33.13 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000604 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1801  terminase small subunit  31.13 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4154  hypothetical protein  30.63 
 
 		 200 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3298  Terminase small subunit  30.2 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3051  Terminase small subunit  30.2 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0406075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2472  Terminase small subunit  28.17 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.325596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1080  hypothetical protein  29.86 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1604  Terminase small subunit  32.32 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0627  hypothetical protein  30.3 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0886  terminase small subunit  26.51 
 
 		 164 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000133411  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0904  terminase small subunit  26.51 
 
 		 189 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00828047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>