More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0885 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 119 aa  239  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0720  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 121 aa  141  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  61.47 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  66.06 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  61.47 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 133 aa  137  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  62.39 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 115 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  59.81 
 
 		 128 aa  131  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  63.46 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  55.86 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0698  ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000127437  hitchhiker  0.00000355367 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  58.65 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 117 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  59.62 
 
 		 119 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 115 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  59.62 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1871  ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00102894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 196 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 120 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 114 aa  121  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  59.57 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 129 aa  120  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 156 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 118 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  60 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  61.7 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 159 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  53.64 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 177 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 125 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1392  50S ribosomal protein L19  58.51 
 
 		 109 aa  119  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0427699  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  52.73 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>