More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1454 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  100 
 
 
124 aa  245  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  75.21 
 
 
120 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0930  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 
121 aa  166  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0468687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  62.9 
 
 
124 aa  153  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
115 aa  143  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
115 aa  143  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  64.35 
 
 
115 aa  143  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 
116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  64.35 
 
 
116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 
114 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 
115 aa  137  6e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  63.48 
 
 
118 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  62.93 
 
 
124 aa  135  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  64.6 
 
 
116 aa  136  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  68.63 
 
 
114 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 
114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 
116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 
115 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
115 aa  134  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  60.38 
 
 
119 aa  133  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  62.83 
 
 
119 aa  133  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
115 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  61.32 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.15 
 
 
115 aa  133  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.55 
 
 
113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  65 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  65 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  60.36 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  61.47 
 
 
114 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 
128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  64.65 
 
 
119 aa  130  5e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  60.53 
 
 
114 aa  130  5e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  59.83 
 
 
116 aa  130  5e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
115 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 
114 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  56.52 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  61.26 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  59.63 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  56.14 
 
 
120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  64 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  61.26 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
114 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 
119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
133 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  54.24 
 
 
117 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 
116 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 
115 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  58.26 
 
 
118 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.65 
 
 
118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1945  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  60.75 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  59.81 
 
 
113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  55.26 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
119 aa  124  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 
118 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
119 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  60.82 
 
 
163 aa  124  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 
116 aa  124  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
115 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  59.81 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  57.01 
 
 
114 aa  123  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  59.81 
 
 
113 aa  123  6e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 
132 aa  124  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 
127 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
119 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
114 aa  123  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 
121 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  59.6 
 
 
136 aa  123  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  59.6 
 
 
136 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  58.88 
 
 
113 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  58.93 
 
 
119 aa  123  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  54.7 
 
 
121 aa  122  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  56.14 
 
 
119 aa  123  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  59.81 
 
 
113 aa  122  1e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
125 aa  122  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 
115 aa  123  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  56.48 
 
 
114 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>