More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09790 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  100 
 
 		 119 aa  238  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  86.96 
 
 		 119 aa  202  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  82.91 
 
 		 118 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  83.19 
 
 		 113 aa  194  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  81.58 
 
 		 118 aa  194  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  84.96 
 
 		 113 aa  194  5.000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  84.21 
 
 		 116 aa  194  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  84.21 
 
 		 121 aa  192  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  80.7 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  78.45 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  77.19 
 
 		 117 aa  180  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  75.44 
 
 		 114 aa  178  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  73.73 
 
 		 121 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  76.11 
 
 		 113 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  76.99 
 
 		 113 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  76.99 
 
 		 113 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  76.99 
 
 		 113 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  74.56 
 
 		 118 aa  176  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  75 
 
 		 116 aa  176  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  73.68 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  75.22 
 
 		 113 aa  176  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  76.99 
 
 		 113 aa  175  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  71.19 
 
 		 120 aa  174  5e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  71.93 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  73.04 
 
 		 119 aa  171  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  75.44 
 
 		 114 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  70.69 
 
 		 120 aa  168  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 117 aa  168  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  73.91 
 
 		 117 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 115 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  71.82 
 
 		 116 aa  166  7e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  73.21 
 
 		 119 aa  166  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  70 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  69.91 
 
 		 113 aa  165  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 114 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  71.05 
 
 		 116 aa  164  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  70.8 
 
 		 117 aa  163  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  70.91 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  70.91 
 
 		 116 aa  162  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  69.03 
 
 		 115 aa  161  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 114 aa  160  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  69.09 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  59.66 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  71.84 
 
 		 114 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 113 aa  158  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 124 aa  158  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  65.77 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  68.42 
 
 		 116 aa  158  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  157  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 113 aa  157  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  69.91 
 
 		 114 aa  156  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  67.86 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 114 aa  154  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  61.82 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  151  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 115 aa  150  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  58.97 
 
 		 128 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 115 aa  147  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 196 aa  145  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 118 aa  144  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 128 aa  144  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 114 aa  144  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  67.65 
 
 		 117 aa  144  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  59.66 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  60.5 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0698  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  143  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000127437  hitchhiker  0.00000355367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  58.68 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  71.72 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  65.42 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 133 aa  140  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  64 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  54.03 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>