More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0765 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 114 aa  223  7e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  70.18 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  70.91 
 
 		 113 aa  164  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  70 
 
 		 128 aa  163  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  69.72 
 
 		 118 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  69.16 
 
 		 114 aa  158  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  64.29 
 
 		 114 aa  157  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 116 aa  157  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 115 aa  156  7e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 115 aa  155  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  69.09 
 
 		 113 aa  154  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 114 aa  153  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 113 aa  152  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  68.81 
 
 		 114 aa  151  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 166 aa  150  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 115 aa  151  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  65.14 
 
 		 115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  66.06 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  67.89 
 
 		 114 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 131 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 117 aa  146  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 180 aa  146  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  145  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 117 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  66.07 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 116 aa  144  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 177 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  143  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 126 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  60.71 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 184 aa  143  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 132 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  61.32 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  57.89 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  57.98 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 162 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  59.83 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 128 aa  140  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 113 aa  140  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 124 aa  140  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 118 aa  140  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 117 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  57.98 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  59.48 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  61.47 
 
 		 114 aa  139  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>