More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1491 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 116 aa  227  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 115 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  70.54 
 
 		 113 aa  161  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 116 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  70.91 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 118 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  67.86 
 
 		 114 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  156  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 115 aa  150  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 117 aa  150  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 113 aa  148  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  64.6 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 124 aa  148  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 116 aa  147  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 114 aa  146  8e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  65.14 
 
 		 113 aa  143  9e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 116 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.56 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 113 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 113 aa  140  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 119 aa  139  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 117 aa  139  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  58.93 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  137  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 114 aa  136  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>