More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11090 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  100 
 
 		 120 aa  239  9e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  76.52 
 
 		 121 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  76.52 
 
 		 118 aa  186  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  73.68 
 
 		 117 aa  181  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 118 aa  178  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  70.59 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  71.55 
 
 		 117 aa  178  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  76.11 
 
 		 113 aa  178  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  73.45 
 
 		 113 aa  178  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  75.44 
 
 		 116 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  68.91 
 
 		 119 aa  177  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  70.69 
 
 		 116 aa  176  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  73.68 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  70.18 
 
 		 114 aa  174  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  70.18 
 
 		 119 aa  174  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  71.19 
 
 		 119 aa  174  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  66.39 
 
 		 121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 		 113 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 118 aa  171  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  68.33 
 
 		 120 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 113 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  70.18 
 
 		 118 aa  170  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 113 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 113 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 113 aa  169  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 114 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 117 aa  169  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  69.03 
 
 		 113 aa  167  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  67.24 
 
 		 116 aa  166  8e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  69.3 
 
 		 119 aa  166  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  67.23 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  67.62 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 113 aa  157  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 118 aa  155  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  65.45 
 
 		 116 aa  153  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  153  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  63.55 
 
 		 114 aa  150  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 116 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 116 aa  150  7e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 119 aa  149  8.999999999999999e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 115 aa  149  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  62.62 
 
 		 114 aa  147  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  66.37 
 
 		 114 aa  147  6e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 118 aa  146  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 115 aa  146  9e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 114 aa  146  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  60 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 119 aa  144  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  54.62 
 
 		 119 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  70.1 
 
 		 196 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  67.33 
 
 		 119 aa  141  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  58.47 
 
 		 121 aa  140  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  66.99 
 
 		 127 aa  139  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 148 aa  138  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  59.05 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  60.38 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  59.43 
 
 		 115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 145 aa  137  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0698  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000127437  hitchhiker  0.00000355367 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  61 
 
 		 141 aa  134  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  62 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 119 aa  134  6.0000000000000005e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  54.24 
 
 		 127 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  54.1 
 
 		 180 aa  133  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>