More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1738 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  68.55 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  67.48 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  61.48 
 
 		 166 aa  146  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  61.48 
 
 		 183 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  60.66 
 
 		 184 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 118 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 120 aa  142  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  60 
 
 		 121 aa  142  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  59.84 
 
 		 180 aa  140  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 116 aa  140  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 116 aa  140  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 121 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  70.1 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  59.46 
 
 		 113 aa  138  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  70.1 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  49.23 
 
 		 133 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  64.22 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  64.22 
 
 		 134 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  67.33 
 
 		 146 aa  137  7e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  69.07 
 
 		 145 aa  137  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 124 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  60 
 
 		 113 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  67.68 
 
 		 127 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 113 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.18 
 
 		 119 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  64.42 
 
 		 140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  58.56 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  60.87 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  66.34 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 117 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 118 aa  134  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  55.12 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  65.35 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  69.07 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  62.38 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  66 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  66 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 129 aa  130  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 118 aa  130  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  59.81 
 
 		 118 aa  130  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 115 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  62.04 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>