More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2274 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  100 
 
 
148 aa  294  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  86.99 
 
 
147 aa  220  6e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  70.59 
 
 
158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  63.39 
 
 
119 aa  147  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  60.18 
 
 
118 aa  144  5e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  63.78 
 
 
146 aa  144  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  69.16 
 
 
127 aa  141  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  60.71 
 
 
116 aa  141  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  62.7 
 
 
183 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  71.29 
 
 
126 aa  140  8e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 
131 aa  140  8e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  68.93 
 
 
180 aa  139  9e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  71.29 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 
184 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  57.14 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 
115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  69 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  72.34 
 
 
177 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  60 
 
 
117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  54.89 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  69 
 
 
134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  54.89 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  70.3 
 
 
131 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
133 aa  138  3e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  70.3 
 
 
129 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  60 
 
 
132 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  70.3 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  70.3 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  57.52 
 
 
116 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60 
 
 
118 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
115 aa  137  7e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 
117 aa  137  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  55.26 
 
 
118 aa  136  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  68 
 
 
130 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2876  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
115 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
117 aa  135  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 
131 aa  135  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
113 aa  135  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  61.11 
 
 
116 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  61.47 
 
 
146 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
124 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  60 
 
 
140 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 
114 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  60.78 
 
 
116 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  59.13 
 
 
118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  72.34 
 
 
148 aa  134  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  62.73 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  61.21 
 
 
127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  60.19 
 
 
117 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  59.02 
 
 
166 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 
117 aa  134  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 
128 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02150  50S ribosomal protein L19  64.55 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  71.28 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  69.15 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  69.15 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1156  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 
133 aa  133  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  57.94 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  58.04 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 
115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  68.09 
 
 
145 aa  131  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 
118 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  57.27 
 
 
121 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  57.66 
 
 
119 aa  131  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  56.76 
 
 
113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
113 aa  131  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1046  50S ribosomal protein L19  57.84 
 
 
134 aa  130  3.9999999999999996e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000242174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  59.82 
 
 
115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 
116 aa  130  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 
117 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 
114 aa  130  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
118 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  50.37 
 
 
163 aa  130  6e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  56.07 
 
 
118 aa  130  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  56.76 
 
 
118 aa  130  7.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  57.94 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  62.96 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
115 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  55.45 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 
116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  52.25 
 
 
119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  58.41 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  55.14 
 
 
131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  57.01 
 
 
119 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
115 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>