More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2487 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  100 
 
 		 146 aa  289  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  61.47 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  64.55 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  66.36 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  65.66 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  65.66 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 117 aa  130  6e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  57.85 
 
 		 126 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.41 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  57.85 
 
 		 126 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  65.31 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  59.09 
 
 		 118 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  60.61 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 145 aa  127  6e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 119 aa  127  6e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 121 aa  127  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  62.63 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 131 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 148 aa  126  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  64.95 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  64.95 
 
 		 145 aa  126  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  61.62 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  61.62 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  63.92 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  58.97 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  55.2 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  54.95 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  55.2 
 
 		 131 aa  123  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  55.2 
 
 		 131 aa  123  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  52.38 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  123  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  55.2 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  49.24 
 
 		 132 aa  123  8.000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 183 aa  123  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 128 aa  122  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  57.58 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  60.78 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  123  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  54.78 
 
 		 114 aa  121  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  61.62 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  54.7 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  60.75 
 
 		 113 aa  121  3e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  63.92 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>