More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0913 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  100 
 
 
119 aa  231  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  84.48 
 
 
116 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
116 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
116 aa  147  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
116 aa  147  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  63.39 
 
 
148 aa  147  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  62.5 
 
 
116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 
133 aa  142  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf247  ribosomal protein L19  62.93 
 
 
118 aa  141  2e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.0015977  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  62.28 
 
 
116 aa  141  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  59.66 
 
 
114 aa  141  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
114 aa  141  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
120 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
114 aa  140  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
115 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
115 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  60.71 
 
 
117 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
115 aa  140  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 
115 aa  140  9e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  64.86 
 
 
119 aa  139  9e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 
115 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  64.22 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
113 aa  137  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  60.91 
 
 
119 aa  138  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  59.46 
 
 
118 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 
115 aa  137  3.9999999999999997e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 
147 aa  137  6e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  61.47 
 
 
114 aa  137  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
119 aa  137  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 
114 aa  136  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  64.55 
 
 
146 aa  136  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 
115 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  61.74 
 
 
124 aa  135  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  58.93 
 
 
115 aa  135  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
115 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
128 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 
115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  60.36 
 
 
119 aa  134  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
115 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0037  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 
121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
115 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  57.27 
 
 
120 aa  134  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
121 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
118 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 
117 aa  133  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  59.09 
 
 
113 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 
115 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 
117 aa  132  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
116 aa  133  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  62.83 
 
 
124 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0075  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 
115 aa  132  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 
127 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  59.63 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  59.63 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
116 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 
114 aa  131  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 
119 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 
118 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  56.64 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  59.8 
 
 
116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  59.62 
 
 
115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  58.56 
 
 
118 aa  130  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  59.09 
 
 
113 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  58.65 
 
 
117 aa  130  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  56.48 
 
 
115 aa  129  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.27 
 
 
119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  56.88 
 
 
115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  57.8 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06780  putative 50S ribosomal protein  54.39 
 
 
118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76728  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  54.55 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  57.14 
 
 
113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 
158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  54.95 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2876  50S ribosomal protein L19  65.66 
 
 
115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 
113 aa  127  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  55.17 
 
 
118 aa  127  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 
117 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 
113 aa  126  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>