More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0946 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  100 
 
 
145 aa  285  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  99.21 
 
 
145 aa  253  5e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  99.21 
 
 
145 aa  253  5e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  76.39 
 
 
146 aa  210  4.9999999999999996e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  74.45 
 
 
166 aa  204  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  72.99 
 
 
184 aa  201  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  72.99 
 
 
183 aa  199  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  72.03 
 
 
177 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  71.53 
 
 
180 aa  197  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  74.58 
 
 
140 aa  187  4e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  66.13 
 
 
130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  68 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  66.42 
 
 
131 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  74.58 
 
 
148 aa  178  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  69.11 
 
 
126 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  65.69 
 
 
131 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  69.11 
 
 
126 aa  176  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  64.57 
 
 
127 aa  173  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  70.59 
 
 
145 aa  173  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  65.85 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  65.93 
 
 
132 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 
134 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 
134 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  68.91 
 
 
130 aa  169  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  65.29 
 
 
131 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  65.29 
 
 
131 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  65.29 
 
 
131 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 
124 aa  167  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  57.64 
 
 
163 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  60.77 
 
 
132 aa  163  9e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  63.33 
 
 
131 aa  161  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  63.71 
 
 
126 aa  160  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  60.98 
 
 
125 aa  159  2e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  60.8 
 
 
124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  65.81 
 
 
117 aa  149  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 
115 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  60.47 
 
 
127 aa  148  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 
135 aa  147  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 
121 aa  146  9e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 
121 aa  146  9e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 
114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 
121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  55.37 
 
 
121 aa  144  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  58.33 
 
 
118 aa  144  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  58.82 
 
 
114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.68 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 
116 aa  144  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  54.55 
 
 
121 aa  143  6e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  66.67 
 
 
114 aa  143  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  58.27 
 
 
146 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  61.21 
 
 
128 aa  143  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  62.71 
 
 
115 aa  142  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 
118 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  58.54 
 
 
127 aa  141  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 
126 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 
115 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2616  50S ribosomal protein L19  64.52 
 
 
123 aa  141  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  59.35 
 
 
127 aa  141  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  56.41 
 
 
117 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  59.35 
 
 
127 aa  141  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  58.47 
 
 
115 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  55.56 
 
 
121 aa  141  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  58.47 
 
 
115 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  61.02 
 
 
117 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  140  5e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
118 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 
117 aa  140  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 
118 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 
113 aa  140  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 
115 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  58.47 
 
 
113 aa  140  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  58.12 
 
 
114 aa  140  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  57.04 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  61.21 
 
 
126 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  57.04 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  56.78 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  59.02 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  64 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
114 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  61.34 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  56.41 
 
 
120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  61.76 
 
 
120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  65.66 
 
 
119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  61.34 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  61.34 
 
 
116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  59.83 
 
 
117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>