More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0217 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 131 aa  254  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  69.53 
 
 		 177 aa  185  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  69.53 
 
 		 183 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  69.53 
 
 		 184 aa  184  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  72.36 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  77.97 
 
 		 132 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  69.53 
 
 		 180 aa  183  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  75.86 
 
 		 145 aa  182  9e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  75 
 
 		 148 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  77.12 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  77.12 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  73.73 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  76.27 
 
 		 130 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  65.62 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  70.16 
 
 		 131 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  68.8 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  68.8 
 
 		 131 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 		 131 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  69.17 
 
 		 126 aa  173  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  69.17 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 124 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 126 aa  160  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  60.8 
 
 		 163 aa  159  9e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  62.81 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 146 aa  157  3e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  64.17 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  65.29 
 
 		 124 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  62.4 
 
 		 128 aa  151  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  61.6 
 
 		 128 aa  149  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  61.6 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  61.6 
 
 		 126 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 127 aa  147  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 126 aa  144  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  63.03 
 
 		 115 aa  143  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 128 aa  143  9e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 127 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 128 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  61.16 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 117 aa  140  7e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  62.39 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  60 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  71.88 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  71.88 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  62.4 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 117 aa  138  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0520  50S ribosomal protein L19  59.84 
 
 		 129 aa  138  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 121 aa  138  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  63 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 115 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  61.34 
 
 		 146 aa  137  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 		 117 aa  137  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2616  50S ribosomal protein L19  64.46 
 
 		 123 aa  137  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  58.82 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 116 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  59.84 
 
 		 135 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  67.71 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  70.83 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1282  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 131 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107761  normal  0.374965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  67.31 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  67.31 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>