More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0507 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 116 aa  237  4e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 163 aa  156  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 132 aa  147  3e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 114 aa  147  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 113 aa  145  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  62.28 
 
 		 114 aa  144  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  59.32 
 
 		 130 aa  144  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  61.21 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  61.21 
 
 		 145 aa  143  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  67.33 
 
 		 117 aa  143  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 119 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  67.35 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  60.87 
 
 		 119 aa  141  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  69.7 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 140 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 114 aa  140  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 113 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  68 
 
 		 119 aa  140  7e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 114 aa  139  9e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  58.62 
 
 		 118 aa  139  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  59.17 
 
 		 135 aa  139  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  68.32 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  58.97 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 		 119 aa  139  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 		 114 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  68 
 
 		 115 aa  139  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  56.3 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  69.31 
 
 		 114 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  68.32 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 127 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  68 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 113 aa  138  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  60 
 
 		 116 aa  138  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 117 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 		 166 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 128 aa  137  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  70.41 
 
 		 127 aa  138  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  60 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  56.9 
 
 		 177 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  57.63 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 116 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 131 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  69.39 
 
 		 118 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  68.32 
 
 		 114 aa  136  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  67.35 
 
 		 196 aa  136  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 126 aa  136  8.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 126 aa  136  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 148 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  55.93 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  67.35 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  58.97 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>