More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2616 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2616  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 123 aa  244  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  86.18 
 
 		 124 aa  216  7e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  84.43 
 
 		 127 aa  215  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1044  50S ribosomal protein L19  86.18 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2705  50S ribosomal protein L19  86.18 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0571233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0185  50S ribosomal protein L19  86.18 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  87.8 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  74.4 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  67.74 
 
 		 184 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  67.48 
 
 		 125 aa  167  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 145 aa  165  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 183 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  66.13 
 
 		 166 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 180 aa  163  5.9999999999999996e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  66.13 
 
 		 177 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  71.3 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  66.13 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  67.48 
 
 		 132 aa  160  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 148 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  65.32 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  65.32 
 
 		 145 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 140 aa  157  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 132 aa  156  8e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  64.23 
 
 		 145 aa  156  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  64 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  66.39 
 
 		 124 aa  155  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  61.6 
 
 		 163 aa  153  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  65.6 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 131 aa  150  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 131 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  64.8 
 
 		 126 aa  149  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  64.46 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  64.8 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 115 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  62.6 
 
 		 127 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 117 aa  141  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  62.6 
 
 		 126 aa  140  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  63.11 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  62.6 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  62.6 
 
 		 127 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 128 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 118 aa  137  6e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 128 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  61.29 
 
 		 128 aa  136  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  61.29 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  60.48 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  60.98 
 
 		 135 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1408  50S ribosomal protein L19  76.07 
 
 		 122 aa  134  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.883642  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  69.7 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  60.33 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  60.66 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 114 aa  133  6.0000000000000005e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  60.33 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  58.62 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  62.4 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  59.02 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2331  50S ribosomal protein L19  64.17 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185348  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  58.26 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  55.46 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  67.68 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  54.62 
 
 		 116 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 119 aa  130  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 127 aa  130  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 129 aa  130  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 116 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>