More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0989 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  100 
 
 
118 aa  236  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  79.13 
 
 
117 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  76.27 
 
 
118 aa  183  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  72.88 
 
 
118 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  70.43 
 
 
120 aa  178  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  76.32 
 
 
117 aa  177  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 
118 aa  176  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  73.04 
 
 
118 aa  175  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  73.04 
 
 
121 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  73.04 
 
 
121 aa  175  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  71.79 
 
 
119 aa  174  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  73.68 
 
 
116 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 
118 aa  173  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  71.93 
 
 
116 aa  172  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  69.57 
 
 
119 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  73.39 
 
 
116 aa  169  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
113 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
113 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  72.57 
 
 
113 aa  170  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 
113 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  69.91 
 
 
113 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  70.8 
 
 
113 aa  168  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  71.05 
 
 
114 aa  167  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  70.18 
 
 
118 aa  167  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  70.18 
 
 
118 aa  167  6e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  71.17 
 
 
120 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 
113 aa  166  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
119 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  68.07 
 
 
119 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  69.91 
 
 
113 aa  165  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  71.96 
 
 
116 aa  165  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 
118 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  66.96 
 
 
119 aa  164  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  70 
 
 
116 aa  160  7e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  64.1 
 
 
118 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 
118 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  69.3 
 
 
114 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 
115 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  72.38 
 
 
118 aa  159  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  70.48 
 
 
116 aa  158  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  68.18 
 
 
116 aa  157  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  68.18 
 
 
116 aa  157  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
115 aa  156  1e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  67.54 
 
 
114 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  67.26 
 
 
113 aa  155  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 
115 aa  153  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
118 aa  153  6e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
118 aa  153  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
114 aa  153  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 
115 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  64.6 
 
 
119 aa  151  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  64.15 
 
 
117 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  66.37 
 
 
114 aa  150  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 
119 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
113 aa  148  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 
115 aa  147  4e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  67.31 
 
 
121 aa  147  6e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  65.45 
 
 
115 aa  146  8e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  61.06 
 
 
119 aa  146  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 
113 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  67.31 
 
 
121 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
128 aa  144  3e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 
131 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 
131 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 
129 aa  144  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  60.18 
 
 
148 aa  143  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  62.04 
 
 
124 aa  142  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  63.96 
 
 
118 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 
127 aa  142  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 
126 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  63.81 
 
 
128 aa  142  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  60.18 
 
 
117 aa  141  2e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  61.82 
 
 
162 aa  141  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 
131 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 
114 aa  141  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  64.15 
 
 
114 aa  141  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 
147 aa  140  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  67.68 
 
 
119 aa  140  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  65.66 
 
 
130 aa  140  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 
126 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  63.73 
 
 
140 aa  140  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
115 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 
115 aa  140  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  65 
 
 
148 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 
131 aa  139  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  62.26 
 
 
115 aa  139  9e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 
116 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 
114 aa  138  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  63.73 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  62.5 
 
 
113 aa  137  4.999999999999999e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>