More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2705 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1044  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2705  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0571233 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0185  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 124 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  89.43 
 
 		 124 aa  221  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  82.79 
 
 		 127 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3884  50S ribosomal protein L19  89.52 
 
 		 126 aa  196  7e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0241892  normal  0.932135 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2616  50S ribosomal protein L19  86.18 
 
 		 123 aa  192  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.133816 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  69.84 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  73.04 
 
 		 131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  73.5 
 
 		 145 aa  163  9e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  72.17 
 
 		 131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 132 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  65.85 
 
 		 125 aa  159  9e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 134 aa  159  9e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  71.3 
 
 		 130 aa  159  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  68.91 
 
 		 184 aa  159  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  68.07 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  68.91 
 
 		 177 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  65.08 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  68.07 
 
 		 183 aa  157  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 148 aa  155  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 131 aa  153  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  63.2 
 
 		 146 aa  153  6e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 132 aa  153  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 126 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 126 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  60.8 
 
 		 163 aa  147  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  60.8 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  60.8 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  62.81 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  61.86 
 
 		 115 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 124 aa  144  5e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  60.16 
 
 		 145 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  64.23 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 127 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 127 aa  135  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  56.1 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  62.1 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  62.1 
 
 		 128 aa  134  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  61.29 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  61.21 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 115 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  59.84 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 121 aa  130  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  65.81 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 116 aa  130  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  58.26 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  55.65 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 129 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 126 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  63.25 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 127 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>