More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1405 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 126 aa  248  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  91.2 
 
 		 128 aa  227  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  88.1 
 
 		 127 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  88.1 
 
 		 127 aa  220  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  90.76 
 
 		 146 aa  219  8e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  87.2 
 
 		 127 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  84.8 
 
 		 126 aa  216  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  88.24 
 
 		 128 aa  212  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  89.66 
 
 		 126 aa  208  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  88.79 
 
 		 117 aa  207  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  87.93 
 
 		 117 aa  206  9e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  84.87 
 
 		 121 aa  206  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  85.71 
 
 		 129 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  82.79 
 
 		 130 aa  205  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  87.6 
 
 		 128 aa  204  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  81.1 
 
 		 128 aa  201  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  87.39 
 
 		 135 aa  201  2e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  81.1 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  85.12 
 
 		 127 aa  201  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  81.1 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 130 aa  200  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0520  50S ribosomal protein L19  87.8 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 129 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  82.68 
 
 		 130 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  82.68 
 
 		 130 aa  196  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1282  50S ribosomal protein L19  84.38 
 
 		 131 aa  196  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107761  normal  0.374965 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  80.31 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  80.31 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  80.31 
 
 		 130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  81.89 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 135 aa  193  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2331  50S ribosomal protein L19  83.06 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185348  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  81.75 
 
 		 127 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  82.81 
 
 		 130 aa  183  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  77.19 
 
 		 119 aa  176  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  73.28 
 
 		 117 aa  175  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  72.41 
 
 		 114 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  75.44 
 
 		 116 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 120 aa  170  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  74.56 
 
 		 116 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  73.91 
 
 		 120 aa  169  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  72.17 
 
 		 117 aa  167  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  76.36 
 
 		 116 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  73.04 
 
 		 117 aa  167  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  76.36 
 
 		 116 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  73.04 
 
 		 117 aa  167  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  76.36 
 
 		 116 aa  167  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  75.45 
 
 		 116 aa  167  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  167  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0527  ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  71.3 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 117 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  71.3 
 
 		 120 aa  164  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  72.73 
 
 		 116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 115 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  72.73 
 
 		 116 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  67.23 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  67.23 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  72.17 
 
 		 118 aa  163  9e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 		 116 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  71.05 
 
 		 117 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  72.81 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  72.81 
 
 		 116 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 115 aa  161  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 134 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  66.39 
 
 		 132 aa  159  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  77.88 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  70.43 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  78.64 
 
 		 142 aa  159  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  76.64 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  68.7 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  71.93 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 114 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 114 aa  158  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  67.83 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  67.83 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  67.83 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  67.83 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  67.83 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>