More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3279 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 126 aa  244  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2150  50S ribosomal protein L19  75.21 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  69.05 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  69.6 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  68.22 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  68.22 
 
 		 184 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  68.22 
 
 		 183 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 163 aa  169  9e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 126 aa  169  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  71.79 
 
 		 125 aa  169  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  67.74 
 
 		 126 aa  168  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  72.88 
 
 		 131 aa  168  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  65.87 
 
 		 129 aa  167  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  67.5 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  67.5 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  67.5 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  60.8 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 180 aa  164  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 127 aa  164  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 148 aa  162  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  72.65 
 
 		 130 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  71.19 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  62.79 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  68.75 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  70.34 
 
 		 132 aa  161  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  64.52 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  64.52 
 
 		 145 aa  160  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  65.81 
 
 		 135 aa  159  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  66.38 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 117 aa  158  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 146 aa  157  4e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  69.23 
 
 		 117 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 127 aa  157  4e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 128 aa  156  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 121 aa  156  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  64.1 
 
 		 132 aa  155  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 127 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 130 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 128 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 126 aa  153  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 130 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 129 aa  153  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 135 aa  151  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0520  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228121  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1282  50S ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107761  normal  0.374965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 127 aa  149  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  70.94 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  63.03 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 117 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 126 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  63.33 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  61.54 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0341  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 124 aa  142  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2331  50S ribosomal protein L19  64.34 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185348  normal  0.0588442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  141  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  141  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 117 aa  140  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>