More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0948 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_0948  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 130 aa  257  4e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.757688  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0952  50S ribosomal protein L19  99.23 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.381908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4186  50S ribosomal protein L19  98.46 
 
 		 130 aa  253  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.105391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  97.69 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  97.69 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  97.69 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  96.92 
 
 		 130 aa  248  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  96.12 
 
 		 129 aa  244  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0772  50S ribosomal protein L19  95.28 
 
 		 127 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123982  normal  0.100319 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1009  50S ribosomal protein L19  92.06 
 
 		 128 aa  228  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2974  50S ribosomal protein L19  91.27 
 
 		 129 aa  220  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185414  normal  0.0681768 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  86.61 
 
 		 128 aa  214  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  85.83 
 
 		 128 aa  213  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  85.04 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  84.38 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  84.38 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  83.59 
 
 		 128 aa  203  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  79.84 
 
 		 127 aa  199  9e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  80.47 
 
 		 126 aa  199  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  82.54 
 
 		 146 aa  199  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  85.59 
 
 		 117 aa  195  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  82.93 
 
 		 128 aa  195  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  81.36 
 
 		 135 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  84.75 
 
 		 117 aa  193  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0751  50S ribosomal protein L19  81.54 
 
 		 130 aa  193  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2537  50S ribosomal protein L19  84.13 
 
 		 127 aa  192  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155158  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  81.82 
 
 		 121 aa  191  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  76.38 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1464  50S ribosomal protein L19  82.2 
 
 		 130 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.889205 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1282  50S ribosomal protein L19  78.74 
 
 		 131 aa  187  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107761  normal  0.374965 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0520  50S ribosomal protein L19  82.64 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228121  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2331  50S ribosomal protein L19  87.18 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185348  normal  0.0588442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  82.68 
 
 		 126 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0572  50S ribosomal protein L19  78.51 
 
 		 135 aa  176  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0280317  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  74.14 
 
 		 119 aa  167  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  70.83 
 
 		 117 aa  166  9e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  70.83 
 
 		 117 aa  166  9e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  68.33 
 
 		 117 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  67.8 
 
 		 114 aa  163  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  69.49 
 
 		 117 aa  163  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  70.09 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  74.55 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  68.07 
 
 		 120 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  71.55 
 
 		 116 aa  160  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  68.38 
 
 		 115 aa  160  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  70 
 
 		 145 aa  159  8.000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  68.07 
 
 		 120 aa  160  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  70.69 
 
 		 116 aa  159  9e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 117 aa  159  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0527  ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  67.23 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  72.73 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  158  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  72.73 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  69.83 
 
 		 116 aa  158  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 115 aa  159  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 115 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3225  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 115 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.639554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  68.97 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0879  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 115 aa  157  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  65.62 
 
 		 129 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 115 aa  157  6e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 118 aa  156  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  65.81 
 
 		 115 aa  155  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  67.52 
 
 		 126 aa  154  3e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  63.85 
 
 		 127 aa  154  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  64.84 
 
 		 126 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  65 
 
 		 117 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>