More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2883 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  228  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  91.3 
 
 		 115 aa  214  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  80.87 
 
 		 115 aa  194  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  82.88 
 
 		 115 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  72.17 
 
 		 115 aa  175  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  70.8 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 115 aa  151  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 115 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  61.06 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 119 aa  137  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 119 aa  133  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 133 aa  133  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 119 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 116 aa  133  7.000000000000001e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  133  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 119 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1945  50S ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  58.18 
 
 		 119 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  130  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  53.57 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  61.68 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 114 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 128 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 124 aa  126  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  53.04 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  58.04 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  62.11 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  62.11 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  62.11 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  54.55 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 		 147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  53.57 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 127 aa  124  5e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09190  LSU ribosomal protein L19P  55.36 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  54.05 
 
 		 117 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>