More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0120 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 124 aa  249  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  62.9 
 
 		 124 aa  153  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0930  50S ribosomal protein L19  65.52 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0468687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  58.12 
 
 		 124 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  134  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  56 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 		 133 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  55.65 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  60.78 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  54.1 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 128 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  54.1 
 
 		 127 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  53.98 
 
 		 114 aa  127  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  56.57 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2182  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 119 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2784  50S ribosomal protein L19  56.03 
 
 		 135 aa  126  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 115 aa  126  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  52.89 
 
 		 142 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 116 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  52.89 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  53.1 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  53.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  57.69 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  53.77 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  55.08 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0217  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  50.88 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  58.59 
 
 		 119 aa  124  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 127 aa  124  6e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  53.51 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 131 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1405  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3087  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  123  9e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228152  normal  0.0603569 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  48.78 
 
 		 125 aa  123  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0296  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 116 aa  123  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000130489  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 114 aa  123  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  49.6 
 
 		 129 aa  123  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0855  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000174926  hitchhiker  0.0000579637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06780  putative 50S ribosomal protein  52.59 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76728  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 127 aa  123  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  50.86 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_002950  PG0037  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0225  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069305 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  60.42 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>