More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0190 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 133 aa  266  5e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  64.6 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  65.79 
 
 		 114 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  58.78 
 
 		 128 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 114 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 114 aa  148  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  147  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 120 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 114 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 119 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 116 aa  144  6e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 116 aa  143  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  58.93 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  141  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 115 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 121 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  140  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  140  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 115 aa  140  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  61.11 
 
 		 119 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1046  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000242174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  53.91 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1800  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0132543  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 115 aa  138  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  58.72 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 148 aa  137  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 113 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 115 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 113 aa  137  6e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 119 aa  137  7e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 115 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  58.72 
 
 		 114 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  54.87 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 131 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1738  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0339925 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  135  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 115 aa  135  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  57.01 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 118 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 114 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 115 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 113 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  61 
 
 		 114 aa  133  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  61.9 
 
 		 113 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  52.73 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  50.83 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  50.83 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  59.05 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 115 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  54.31 
 
 		 124 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  60.95 
 
 		 113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 124 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  59 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  55.45 
 
 		 114 aa  130  6.999999999999999e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  50.88 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1221  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000033527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1234  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000814658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>