More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0317 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 131 aa  265  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  88.97 
 
 		 136 aa  233  9e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  88.97 
 
 		 136 aa  218  3e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 124 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 116 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.38 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  56.86 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  55.24 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  52.53 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  55.14 
 
 		 115 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1274  ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 118 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  51.89 
 
 		 116 aa  126  9.000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 116 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  62.11 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  53.51 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  55.24 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  55.24 
 
 		 114 aa  124  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  56.07 
 
 		 118 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  53.7 
 
 		 116 aa  123  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 124 aa  123  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  58.82 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  56.48 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  57.29 
 
 		 113 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 118 aa  122  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  55.14 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  52.83 
 
 		 114 aa  122  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  55.88 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  59.38 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  54.63 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.29 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  53.27 
 
 		 115 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  60.42 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl539  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000175724  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  58.25 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  56.12 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  48.65 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  54.08 
 
 		 117 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  50.48 
 
 		 119 aa  120  7e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  54.29 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  54.17 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0930  50S ribosomal protein L19  56.07 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0468687 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  51.89 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  47.54 
 
 		 117 aa  119  9e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1046  50S ribosomal protein L19  54.37 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000242174  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  55.21 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  55.24 
 
 		 115 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  52.88 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  52.38 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  52.38 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  52.38 
 
 		 113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  52.83 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  55.21 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  54.17 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  53.47 
 
 		 130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  50.46 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  55.67 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2487  ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  0.285448 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  55.79 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  55.67 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  55.67 
 
 		 131 aa  117  6e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  55.1 
 
 		 145 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>