More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0040 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2182  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 116 aa  149  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06780  putative 50S ribosomal protein  59.13 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.76728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 120 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1331  ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 116 aa  140  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0075  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0037  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 121 aa  140  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  63.37 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 113 aa  139  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  59.43 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 119 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 119 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  61.32 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 113 aa  135  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  62.63 
 
 		 116 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  64.29 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  57.52 
 
 		 114 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 127 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  64.36 
 
 		 114 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 113 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 118 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 113 aa  133  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 119 aa  133  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 113 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 114 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 128 aa  131  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 119 aa  131  3.9999999999999996e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 114 aa  130  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 115 aa  130  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 148 aa  130  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 116 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 115 aa  130  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 124 aa  130  7.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  59.41 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  59.41 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  59.41 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  59.41 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0930  50S ribosomal protein L19  63.37 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0468687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  56.6 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  57.55 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  59.41 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  53.77 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  58.76 
 
 		 114 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  51.79 
 
 		 116 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1521  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 120 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.309648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  56.14 
 
 		 114 aa  127  7.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  50 
 
 		 120 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  57.66 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  51.75 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  59.41 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 133 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 119 aa  124  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>