More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1156 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1156  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  85.94 
 
 		 136 aa  228  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  85.94 
 
 		 136 aa  228  2e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02150  50S ribosomal protein L19  88.98 
 
 		 138 aa  217  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  72.73 
 
 		 115 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  68.64 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  67.26 
 
 		 117 aa  160  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  66.95 
 
 		 117 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 		 117 aa  158  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 116 aa  157  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  66.96 
 
 		 118 aa  157  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  68.14 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  68.14 
 
 		 117 aa  156  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 116 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 116 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  64.66 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  65.22 
 
 		 115 aa  154  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3767  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000116222  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 116 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  63.79 
 
 		 116 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  64.71 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  65.25 
 
 		 115 aa  152  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  64.41 
 
 		 120 aa  152  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1580  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 		 120 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  65.81 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  65.81 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 117 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  63.71 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0463  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0439  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 121 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  61.42 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2700  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3352  50S ribosomal protein L19  62.18 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459545  normal  0.21243 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3364  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 		 119 aa  144  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 117 aa  144  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3063  50S ribosomal protein L19  63.48 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.7389400000000002e-23  unclonable  0.0000000280297 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  66.67 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  61.42 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  63.56 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2758  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0531203  normal  0.0143177 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02459  hypothetical protein  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0136468  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1077  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00292053  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2765  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315914  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  141  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  60.83 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0395  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 114 aa  141  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2231  50S ribosomal protein L19  59.52 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2916  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0400  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311266  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2965  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.618021  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0231  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1664  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 131 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2856  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0887  50S ribosomal protein L19  62.61 
 
 		 117 aa  140  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00504476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2542  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0263241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0916  50S ribosomal protein L19  59.06 
 
 		 129 aa  140  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3001  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2887  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00407134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2889  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.317443  normal  0.332648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2868  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0111282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2818  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 115 aa  140  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241725  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0994  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.205285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  66.35 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  66.35 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 126 aa  140  8e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2857  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1127  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.658651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3200  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000327928  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1031  50S ribosomal protein L19  58.73 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0593  50S ribosomal protein L19  58.73 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.095314  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1072  50S ribosomal protein L19  58.73 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242616  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  62.28 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3361  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.407849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>