More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2876 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2876  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  229  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  64.91 
 
 		 117 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0802  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 162 aa  139  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 116 aa  137  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  62.73 
 
 		 114 aa  137  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 116 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  63.16 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  63.16 
 
 		 117 aa  135  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4066  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 117 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  63.3 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2277  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0122186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 115 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 116 aa  134  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 114 aa  133  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 147 aa  133  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1206  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000437176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 117 aa  132  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  61.11 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3445  50S ribosomal protein L19  62.38 
 
 		 166 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.549139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  62.75 
 
 		 183 aa  130  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3013  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 119 aa  130  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.028124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 115 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 117 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2319  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 142 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.556938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 118 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 115 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 119 aa  129  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 119 aa  129  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  64.95 
 
 		 113 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2016  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  64.65 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  57.27 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  62 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  62.75 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  60.55 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  64.58 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  64.58 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  63.27 
 
 		 127 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  54.55 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 116 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  61.46 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  59.09 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 115 aa  128  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 116 aa  128  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4210  50S ribosomal protein L19  59.8 
 
 		 180 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.425838  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  53.64 
 
 		 118 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3364  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  65.66 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  58.18 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 117 aa  127  6e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  62.89 
 
 		 118 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 116 aa  127  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 117 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>