More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1046 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1046  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000242174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 133 aa  139  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 115 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2274  ribosomal protein L19  57.84 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.109291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  57.01 
 
 		 115 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  58.95 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1011  50S ribosomal protein L19  56.19 
 
 		 147 aa  124  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00140547  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 115 aa  124  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  56.44 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  55.34 
 
 		 114 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  54.87 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  55.79 
 
 		 115 aa  123  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  51.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  53.27 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  51.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  60.4 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  120  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  53.98 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  49.58 
 
 		 125 aa  120  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  61.39 
 
 		 115 aa  120  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  54.9 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  56.86 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  56.36 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  58.95 
 
 		 148 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4154  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 116 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237739  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3398  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1465  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0559636  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1070  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.199934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1024  50S ribosomal protein L19  57.29 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.688153  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  54.37 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1022  50S ribosomal protein L19  59 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  0.522739 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4256  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  57.43 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 115 aa  119  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  57.43 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1476  ribosomal protein L19  59 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0735287  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1285  50S ribosomal protein L19  59 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  52.25 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  51.35 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  50.44 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1377  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.134338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 113 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  54.74 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16000  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 116 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000973438  normal  0.502722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  53.27 
 
 		 119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  51.33 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2003  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000253757  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  55.45 
 
 		 131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39530  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0334012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  53.15 
 
 		 116 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  51.4 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1331  ribosomal protein L19  56.14 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1912  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 131 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.775463  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0739  ribosomal protein L19  48.8 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000570973 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 118 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0650  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 115 aa  117  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0345381  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  53.92 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0348  ribosomal protein L19  57.45 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2783  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.101505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 126 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  53.4 
 
 		 116 aa  116  7.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  51.26 
 
 		 140 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1474  ribosomal protein L19  52.48 
 
 		 121 aa  116  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0170029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  49.56 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 118 aa  116  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  52.73 
 
 		 134 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>