More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2403 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  226  9e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  64.35 
 
 		 115 aa  162  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 117 aa  150  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 115 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1404  ribosomal protein L19  61.47 
 
 		 115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  61.47 
 
 		 114 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60.87 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 116 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 115 aa  137  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 114 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  56.76 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  57.52 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 115 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  60.71 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  64.81 
 
 		 114 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3678  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 196 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 115 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 119 aa  135  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 118 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  59.63 
 
 		 116 aa  134  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 113 aa  134  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0652  50S ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 117 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.520317  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 121 aa  133  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 116 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1831  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0901138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03477  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 116 aa  131  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  59.26 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002539  LSU ribosomal protein L19p  59.82 
 
 		 117 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000131397  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1373  LSU ribosomal protein L19P  59.26 
 
 		 113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000974692  normal  0.351017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 117 aa  130  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 115 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  57.39 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 113 aa  130  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 124 aa  130  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  65.31 
 
 		 119 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 116 aa  130  7.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  58.04 
 
 		 113 aa  129  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1516  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.51247  normal  0.0391873 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  57.8 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  58.93 
 
 		 113 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 119 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  60.19 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  128  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  56.88 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  53.21 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  50.89 
 
 		 114 aa  126  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  57.41 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  54.63 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  57.02 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  54.13 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  57.14 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10370  LSU ribosomal protein L19P  56.88 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000106379  unclonable  0.000000000798252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3255  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 118 aa  124  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  58.1 
 
 		 113 aa  125  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  58.04 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 117 aa  124  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>