More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5090 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5090  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290678  normal  0.249753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1454  ribosomal protein L19  75.21 
 
 		 124 aa  182  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1354  normal  0.387508 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0930  50S ribosomal protein L19  67.5 
 
 		 121 aa  165  2e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0468687 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0120  50S ribosomal protein L19  62.39 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.332554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0040  ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.266371  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1031  ribosomal protein L19  59.65 
 
 		 124 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.980143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  57.76 
 
 		 116 aa  137  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 118 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  57.26 
 
 		 114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  54.39 
 
 		 114 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  56.64 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  62.26 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  56.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  60.95 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  60.58 
 
 		 115 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0317  50S ribosomal protein L19  55.86 
 
 		 131 aa  128  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000173256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  55.75 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1497  ribosomal protein L19  55.96 
 
 		 113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0292174  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  55.56 
 
 		 114 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  56.25 
 
 		 115 aa  127  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  54.46 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0190  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0338  50S ribosomal protein L19  60 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00142786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0302  ribosomal protein L19  57.89 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  57 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  52.17 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  59.43 
 
 		 115 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 113 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  55.26 
 
 		 128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  59.43 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  53.57 
 
 		 115 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_279  ribosomal protein L19  59 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0178386  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  58 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  59.22 
 
 		 115 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  60.38 
 
 		 118 aa  123  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  59 
 
 		 114 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0849  ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 117 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  52.68 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  54.78 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1331  ribosomal protein L19  58.56 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 115 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1034  50S ribosomal protein L19  55.05 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0428583  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  55.77 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07000  LSU ribosomal protein L19P  57 
 
 		 114 aa  121  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000223468  normal  0.416824 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0561  50S ribosomal protein L19  59.6 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.418065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  55.14 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  55.36 
 
 		 115 aa  120  6e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  60.78 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  60.78 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2403  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 115 aa  120  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000572528  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  54.37 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2021  ribosomal protein L19  56.6 
 
 		 118 aa  120  9e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.143902  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0203  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000333718  normal  0.100248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  58 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0913  ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  55.34 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  57.28 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2917  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000537691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  56.31 
 
 		 113 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  52.21 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2751  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000896071  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  55 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  53.04 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0430  ribosomal protein L19  55.65 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575588  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0549  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  8.959370000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1632  50S ribosomal protein L19  51.3 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000160789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2052  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0075  50S ribosomal protein L19  48.72 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1967  50S ribosomal protein L19  52.78 
 
 		 131 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.420885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  58.33 
 
 		 132 aa  118  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0892  50S ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 117 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00545492  normal  0.499418 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>