More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0268 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0268  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.118712  normal  0.0551314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2549  50S ribosomal protein L19  77.95 
 
 		 130 aa  193  7e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000188294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1023  ribosomal protein L19  76.38 
 
 		 120 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00623227 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1043  50S ribosomal protein L19  77.95 
 
 		 120 aa  191  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00000555964  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1767  50S ribosomal protein L19  74.8 
 
 		 120 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00973634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1743  50S ribosomal protein L19  74.8 
 
 		 120 aa  187  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2541  50S ribosomal protein L19  72.44 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00272416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0439  ribosomal protein L19  72.44 
 
 		 120 aa  179  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123556  normal  0.5766 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05001  50S ribosomal protein L19  68 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05301  50S ribosomal protein L19  68 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05391  50S ribosomal protein L19  67.48 
 
 		 156 aa  174  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.589917  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0475  50S ribosomal protein L19  72.41 
 
 		 156 aa  170  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04761  ribosomal protein L19  78.64 
 
 		 163 aa  170  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.603852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1716  50S ribosomal protein L19  64 
 
 		 150 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0643  50S ribosomal protein L19  64 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.886918 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1808  50S ribosomal protein L19  66.94 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0350868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05311  50S ribosomal protein L19  75.49 
 
 		 162 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.105613 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06821  50S ribosomal protein L19  69.91 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0765  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000038778  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2409  50S ribosomal protein L19  60.95 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.116113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2510  ribosomal protein L19  53.72 
 
 		 140 aa  126  8.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0226  50S ribosomal protein L19  52.85 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000854826  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0714  50S ribosomal protein L19  52.07 
 
 		 116 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000264859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07350  ribosomal protein L19  50.41 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000105105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  54.7 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 119 aa  123  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5201  50S ribosomal protein L19  55.37 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.952267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4734  50S ribosomal protein L19  55.37 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3279  50S ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  55.17 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  54.62 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  52.1 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 125 aa  121  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5273  50S ribosomal protein L19  55.83 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.987122 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  52.59 
 
 		 115 aa  121  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  53.45 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0638  50S ribosomal protein L19  53.78 
 
 		 145 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.056681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1708  50S ribosomal protein L19  54.24 
 
 		 114 aa  120  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00482278  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0885  50S ribosomal protein L19  53.85 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0069103  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0936  50S ribosomal protein L19  52.1 
 
 		 128 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0118366 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1871  ribosomal protein L19  58.42 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00102894  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4426  50S ribosomal protein L19  55 
 
 		 131 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  52.63 
 
 		 163 aa  120  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0956  50S ribosomal protein L19  54.17 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.456923  normal  0.670119 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  54.24 
 
 		 113 aa  120  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0807  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 128 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0878  50S ribosomal protein L19  52.54 
 
 		 128 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.714575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0946  50S ribosomal protein L19  50.83 
 
 		 145 aa  120  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1491  50S ribosomal protein L19  54.62 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1907  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.371938  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1835  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.610841  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0087  50S ribosomal protein L19  51.26 
 
 		 146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  56.6 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0198  ribosomal protein L19  51.67 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.00000000492639  normal  0.504324 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  51.72 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1962  50S ribosomal protein L19  55.46 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  52.14 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3101  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.255374  normal  0.735203 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  50.86 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  52.5 
 
 		 115 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1107  50S ribosomal protein L19  50.42 
 
 		 117 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  50.43 
 
 		 114 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0364  50S ribosomal protein L19  53.33 
 
 		 127 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1887  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 128 aa  118  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000459449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0827  50S ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 128 aa  117  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  49.14 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  55.66 
 
 		 114 aa  117  6e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1413  ribosomal protein L19  57.58 
 
 		 119 aa  117  6e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0684  50S ribosomal protein L19  50 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01708  50S ribosomal protein L19  48.36 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0189538  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3396  50S ribosomal protein L19  54.17 
 
 		 131 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.2335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 118 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3755  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.649636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4078  50S ribosomal protein L19  51.75 
 
 		 184 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1299  ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0178063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0242  50S ribosomal protein L19  53.28 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2257  50S ribosomal protein L19  49.17 
 
 		 115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00054587  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1693  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5342  ribosomal protein L19  50.41 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1476  ribosomal protein L19  51.69 
 
 		 127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  58.59 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0090  50S ribosomal protein L19  49.15 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0076  50S ribosomal protein L19  49.15 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2376  50S ribosomal protein L19  50.85 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.488088 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0349  50S ribosomal protein L19  53.72 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0742  50S ribosomal protein L19  52.99 
 
 		 127 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0506  50S ribosomal protein L19  53.72 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3582  50S ribosomal protein L19  52.46 
 
 		 126 aa  115  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1680  50S ribosomal protein L19  55.34 
 
 		 117 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.167471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  54.72 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>